CARACTERIZACIÓN DEL MICROBIOMA RUMINAL DEL GANADO RARÁMURI DEL ESTADO DE CHIHUAHUA POR NGS: UN ENFOQUE COMPARATIVO

MÁYNEZ PÉREZ, ADRIÁN OMAR (2022) CARACTERIZACIÓN DEL MICROBIOMA RUMINAL DEL GANADO RARÁMURI DEL ESTADO DE CHIHUAHUA POR NGS: UN ENFOQUE COMPARATIVO. Maestría thesis, UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE CHIHUAHUA.

Vista Previa

Text Tesis.pdf Download (1252Kb) | Vista Previa

Resumen

Las razas bovinas adaptadas han cobrado importancia en los últimos años como alternativa ante la problemática que supone el cambio climático. Entender la relación entre el animal y el ecosistema microbiano que habita su rumen permitirá identificar características ventajosas de estas razas con respecto a otras comúnmente utilizadas. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar el microbioma ruminal del ganado Rarámuri en pastoreo y compararlo con el de razas europeas como con la cruza. Un total de 28 hembras bovinas de tres linajes se mantuvieron en pastoreo durante 45 d en un mismo potrero. Posteriormente, se obtuvo una muestra de líquido ruminal de la cual se extrajo DNA y la región V4 del gen 16s rRNA fue secuenciada. Los datos de secuenciación fueron analizados con el software QIIME2 y comparadas contra la base de datos SILVA 16s rRNA. Se realizó un análisis LEfSe para identificar grupos microbianos diferenciados. Se encontró en los animales la presencia de un núcleo microbiano conformado principalmente por los filos Bacteroidetes y Firmicutes. Las diferencias en los ecosistemas microbianos entre el ganado Rarámuri y europeo se identificaron a través del índice de diversidad beta UniFrac no ponderado (P<0.05), así como en el análisis LEfSe que identificó cinco grupos microbianos diferenciados para cada uno de los linajes. Las diferencias observadas entre linajes muestran la capacidad de adaptación del ecosistema ruminal del ganado Rarámuri a las condiciones medioambientales hostiles pues se caracteriza por tener grupos microbianos especializados en la degradación de compuestos con un alto contenido fibroso.

Actions (login required)

Ver Objeto